土木工程一级学科依托济南大学土木建筑学院，设有土木工程（国家一流专业、工程教育认证专业、山东省特色专业、山东省高水平应用型专业）与给排水科学与工程（国家一流专业、工程教育认证专业、山东省特色专业、山东省高水平应用型专业）两个本科专业，并于2003年获“结构工程”硕士学位授予权，2006年获“防灾减灾工程及防护工程”硕士学位授予权，2010年获“土木工程”一级学科硕士学位授予权与“建筑与土木工程”领域工程硕士学位授予权。2018年土木工程一级学科列为济南大学博士点培育学科，2019年，全国工程硕士学位授权点布局调整，将原“建筑与土木工程”领域工程硕士授权点调整为“土木水利”工程硕士学位授权点。2021年获“城乡规划”一级学科硕士学位授予权，2023年开始土木工程（081400）同等学力申请硕士学位招生培养，同时调整增设“工程管理”（125601）非全日制工程硕士授权点。

“土木工程”一级学科（学术型，081400）下设结构工程（01）、岩土工程（02）、市政工程（03）、防灾减灾工程及防护工程（04）四个二级学科；“土木水利”(专业型，085900) 涉及土木工程（085901）、市政工程（含给排水等）（085905）两个研究领域/方向；

城乡规划一级学科依托济南大学土木建筑学院，设有城乡规划（山东省一流专业、“全国北方规划教育联盟”成员单位）一个本科专业，始建于1998年，具有24年办学历史，并于2022年获“城乡规划学（083300）”一级学科硕士学位授予权，为省内三个培养硕士研究生的城乡规划学科之一。

“城乡规划学”一级学科（学术型，083300），不区分方向，首批硕士研究生招生将于2022年招考（2023年9月入学）。

“工程管理”（专业型，125601）工程硕士范围涉及工程项目管理（01），物流工程与管理（02），质量工程与标准化（03）三个研究领域/方向，该学位的人才培养与商学院合作，招生与课程由商学院负责，研究生学位论文在我院完成，目前仅招收非全日制硕士研究生。

学院硕士研究生学制均为三年，年均招生量约60名，其中学术型与专业型招生比例约1:2.5，研究生导师数量逐年增多，现拥有学术型导师21名，专业型导师27名，同时还聘请数十位国内外知名教授或知名企业高级工程师担任讲座教授、兼职教授和校外合作导师。目前已累计培养研究生500余名，受到社会和行业的高度认可，成为国内具有一定影响力的土木工程人才培养基地。